Oreki Houtarou é um garoto do Ensino Médio minimalista. Um dia, ele se junta ao clube de literatura clássica (Koten-Bu), a pedido de sua irmã mais velha. Lá ele encontra Chitanda Eru, Fukube Satoshi, e Ibara Mayaka. Chitanda é uma bela garota calma, mas ela se transforma em uma encarnação da curiosidade, uma vez que ela diz: “Eu estou interessado nele (Watashi, Ki ni Narimasu)”. Fukube é um garoto de sorriso com uma memória fantástica que se auto-proclama um banco de dados. Ibara é uma garota pequena e é rigorosa com os outros e com si mesma. Ela gosta do Fukube, mas ele sempre se esquiva de suas abordagens. Eles começam a investigar um caso que ocorreu há 45 anos. Dicas do mistério são enterrados em uma antiga coleção de obras dos antigos membros do Clube de Literatura Clássica. A coleção é intitulado “Hyouka”.