Em 2016, um colapso de uma usina nuclear cria uma grande catástrofe em Tokyo. 20 anos depois, a cidade se torna uma cidade fantasma, devido aos altos níveis de radiação. Dessa área um sinal de socorro é recebido. As forças de Auto Defesa enviam 3 garotas da Unidade Especial Coppelion para procurar por sobreviventes. Mas por que elas não estão usando nenhuma proteção contra a radiação?