Pouquíssimos garotos e garotas adolescentes apresentam início do uso de habilidades especiais. Yuu Otosaka usa sua habilidade sem o conhecimento das outras pessoas, a fim de levar uma vida escolar satisfatória. E então, uma garota chamada Nao Tomori de repente aparece diante dele. O encontro revela o destino para os detentores da habilidades especiais.